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Matematica Per La Biologia Computazionale E La Computer Science

 

Prof.
Cristiano Bocci
University of Siena - Dipartimento di Ingegneria dell'Informazione e Scienze Matematiche
Course Type
Group 2
Calendar
1 ottobre- 2 novembre 2012
Room
Program
Teoria di Markov • Catene di Markov • Modelli di Markov • procedimento di calcolo su modelli di Markov • Applicazioni alla speech recognition (facoltativo) Concetti di base di Aritmetica Tropicale • operazioni base • matrici e determinante tropicale Programmazione dinamica • algoritmo di Floyd-Warshall • programmazione intera lineare • assignment problem Sequence alignment • Numeri di Delannoy • Grafo di allineamento • GAP (global alignment problem) • Algoritmo di Needleman-Wunsch • Grafo di allineamento esteso • esempi computazionali Mappe di dissimiglianza • spazio degli alberi filogenetici • four-point condition • cherry-picking theorem • algoritmo neighbor-joining • algoritmo neighbor-net • tree reconstructions





 

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